Период с 1613 по 1645 совпал с временем правления Михаила Федоровичем Романова.

После освобождения столицы от интервентов возникла необходимость в выборе нового государя. С этой целью в 1613 г был созван Земский собор. В 1613 г. на российский престол, помимо Михаила Романова, претендовали как представители местной знати, так и представители правящих династий соседних стран. Кандидатами на престол были: польский королевич Владислав, шведский королевич Карл Филипп, Голицыны, Годуновы и Шуйские, Дмитрий Пожарский и Дмитрий Трубецкой.  Избрание Михаила Фёдоровича было обусловлено рядом причин: его происхождением (согласно решению Земского собора царь должен быть русским), род Романовых был знатным боярским родом, и его представители в разное время поддерживали разных правителей, поэтому никто не опасался опалы в случае восшествия Романова на престол; так же существовал расчет на то, что юным и неопытным Михаилом Федоровичем можно будет управлять. Кроме того, «Повесть о Земском соборе 1613 года» утверждает, что Федора Романова на царствие благословил еще Федор Иоаннович, поэтому он был законным правителем. Поскольку же Федор Никитич был тогда в польском плену, на трон должен был взойти его сын. Таким образом, Михаил Федорович сел на трон, став первым царем новой династии Романовых, которая просуществует в России вплоть до Февральской революции 1917 года. 

Царская власть новой династии была очень шаткой. На российский престол всё ещё претендовали польский королевич Владислав и шведский принц Карл Филип. Власти Михаила Фёдоровича угрожал и сын Марины Мнишек за которым до сих пор стояло казацкое войско. По этой причине в 1614 году были схвачены и казнены Заруцкий и «воронёнок Ивашка».  А в 1617 году был подписан Столбовский мир со Швецией. По его итогу России был возвращен Новгород, а Швеция сохранила за собой балтийское побережье. Но более важно было то, что шведский король отказывался от притязаний на русский трон и признавал легитимность династии Романовых.  В 1618 году королевич Владислав предпринимает военный поход на Москву, но он был отражен русскими войсками. Понимая, что Россия не может постоянно отбивать натиски врага, стране необходим мир для того что бы восстановить силы, Михаил Федорович в 1618 году подписывает Деулинское перемирие с Польшей, по итогу которого за Польшей оставались Смоленск и Чернигов.  Но в отличии от шведского короля Владислав не отказался от претензий на русский престол.  Данный факт и потеря земель стали поводом для Смоленской войны 1632-1634. Ее итогом стало подписание Поляновского договора, по которому подтверждались условия Деулинского перемирия, а самое главное Владислав признал легитимность в